Determinazione quantitativa di mRNA tramite trascrizione inversa (RT)-Real time PCR come indice di vitalità dell'inoculo di Phytophthora spp. nel suolo e nel materiale vegetale: amplificazione del RNAm dei geni COX I e COX II

    Progetto: Research project

    Dettagli progetto

    Description

    Questa UO svilupperà, in stretta collaborazione con l’UO IV e con ricercatori dell’Università di Berkeley (California, USA), un novo metodo di diagnosi molecolare basato sulla RT-PCR in tempo reale, con primer disegnati sulla base delle sequenze di cDNA ottenute, a loro volta, da trascritti (mRNA) dei geni mitocondriali COX I e COX II. I compiti di questa UO saranno i seguenti: ottimizzazione dei metodi di campionamento; messa a punto dei procedimenti di estrazione dell’mRNA dalle matrici (tessuti vegetali, terreno, acqua); sintesi del cDNA tramite “two steps” RT-PCR; disegno di sonde TaqMan; validazione del nuovo metodo e confronto con altri metodi di diagnosi; applicazione del nuovo metodo per lo studio dell’ecologia di Phytophthora spp. in ambienti naturali e per la diagnosi di specie da quarantena.
    StatoAttivo
    Data di inizio/fine effettiva1/1/06 → …