• 665 Citazioni
  • 14 Indice H
20022019
In caso di modifiche a Pure, queste saranno visibili qui a breve.

Risultato della ricerca 2004 2019

  • 665 Citazioni
  • 14 Indice H
  • 41 Article
  • 18 Chapter
  • 6 Other
  • 2 Conference contribution
2019
2 Citazioni (Scopus)
Genomics
Electric sparks
Statistics
Technology
MapReduce
1 Citazione (Scopus)

A new class of searchable and provably highly compressible string transformations

Sciortino, M., Giancarlo, R., Rosone, G. & Manzini, G., 2019, Leibniz International Proceedings in Informatics, LIPIcs. pag. 1-12 12 pag. (LEIBNIZ INTERNATIONAL PROCEEDINGS IN INFORMATICS).

Risultato della ricerca: Conference contribution

Data structures
Mathematical transformations
1 Citazione (Scopus)
Chromatin
Computer science
Computer Science
Genome
DNA
2018
3 Citazioni (Scopus)

Block Sorting-Based Transformations on Words: Beyond the Magic BWT

Giancarlo, R., Rosone, G., Sciortino, M., Restivo, A., Rosone, G. & Manzini, G., 2018, pag. 1-17. 17 pag.

Risultato della ricerca: Other

Burrows-Wheeler Transform
Sorting
Mathematical transformations
Data compression
Combinatorics on Words
8 Citazioni (Scopus)

Informational and linguistic analysis of large genomic sequence collections via efficient Hadoop cluster algorithms

Giancarlo, R., Roscigno, G., Ferraro Petrillo, U., Cattaneo, G. & Ferraro Petrillo, U., 2018, In : Bioinformatics. 34, pag. 1826-1833 8 pag.

Risultato della ricerca: Article

Cluster Algorithm
Linguistics
Genomics
MapReduce
Genome
2 Citazioni (Scopus)
Nucleosomes
Histones
Genome
Genes
Glossaries
2017
16 Citazioni (Scopus)

An effective extension of the applicability of alignment-free biological sequence comparison algorithms with Hadoop

Giancarlo, R., Roscigno, G., Petrillo, U. F. & Cattaneo, G., 2017, In : THE JOURNAL OF SUPERCOMPUTING. 73, pag. 1467-1483 17 pag.

Risultato della ricerca: Article

Sequence Comparison
Alignment
Sequential machines
Computational Biology
Bioinformatics

Computation Cluster Validation in the Big Data Era

Giancarlo, R. & Utro, F., 2017, Reference Module in the Life Sciences.

Risultato della ricerca: Chapter

Microarrays
Big data
15 Citazioni (Scopus)

FASTdoop: A versatile and efficient library for the input of FASTA and FASTQ files for MapReduce Hadoop bioinformatics applications

Giancarlo, R., Roscigno, G., Petrillo, U. F. & Cattaneo, G., 2017, In : Bioinformatics. 33, pag. 1575-1577 3 pag.

Risultato della ricerca: Article

MapReduce
Bioinformatics
Computational Biology
Libraries
Availability
4 Citazioni (Scopus)

Mapreduce in computational biology - A synopsis

Giancarlo, R., Roscigno, G., Di Biasi, L., Petrillo, U. F., Piotto, S. & Cattaneo, G., 2017, Advances in Artificial Life, Evolutionary Computation, and Systems Chemistry, 11th Italian Workshop, WIVACE 2016, Fisciano, Italy, October 4-6, 2016, Revised Selected Papers. pag. 53-64 12 pag. (COMMUNICATIONS IN COMPUTER AND INFORMATION SCIENCE).

Risultato della ricerca: Chapter

Bioinformatics
Middleware
Distributed computer systems
Electric sparks
Processing

MapReduce in Computational Biology Via Hadoop and Spark

Giancarlo, R. & Ferraro Petrillo, U., 2017, Reference Module in the Life Sciences.

Risultato della ricerca: Chapter

Bioinformatics
Electric sparks
Scalability

Network Centralities and Node Ranking

Giancarlo, R., Rombo, S. E. & Landolina, F., 2017, Reference Module in Life Sciences.

Risultato della ricerca: Chapter

Electric network analysis
2016

Indexed Two-Dimensional String Matching

Giancarlo, R., 2016, Encyclopedia of Algorithms. pag. 973-977 5 pag.

Risultato della ricerca: Chapter

Table Compression

Giancarlo, R., 2016, Encyclopedia of Algorithms. pag. 2193-2198 6 pag.

Risultato della ricerca: Chapter

9 Citazioni (Scopus)
Nucleosomes
Genome
DNA
Genes
Computational Biology
2015
6 Citazioni (Scopus)

Alignment-Free Sequence Comparison over Hadoop for Computational Biology

Giancarlo, R., Roscigno, G., Petrillo, U. F. & Cattaneo, G., 2015, Proceedings of the International Conference on Parallel Processing Workshops. pag. 184-192 9 pag.

Risultato della ricerca: Conference contribution

Sequence Comparison
Computational Biology
Alignment
Parallel architectures
Bioinformatics
2 Citazioni (Scopus)

Bayesian versus data driven model selection for microarray data

Lo Bosco, G., Giancarlo, R., Utro, F. & Lo Bosco, G., 2015, In : Natural Computing. 14, pag. 393-402 10 pag.

Risultato della ricerca: Article

Microarrays
Information use
Computer science
Statistical methods
Identification (control systems)
14 Citazioni (Scopus)
Nucleosomes
Glossaries
Epigenomics
Positioning
Genomics
2 Citazioni (Scopus)
Microarray Analysis
Microarrays
Libraries
Cluster Analysis
Cluster analysis
2014
37 Citazioni (Scopus)
DNA sequences
Sequence Analysis
Throughput
Availability
Technology
3 Citazioni (Scopus)

GIMT: A tool for ontology and goal modeling in BDI Multi-Agent Design

Seidita, V., Giancarlo, R., Sabatucci, L., Ribino, P., Lodato, C., Nogare, D. D., Giancarlo, R., Lopes, S., Seidita, V. & Cossentino, M., 2014. 8 pag.

Risultato della ricerca: Other

2013

Algorithmics for the Life Sciences

Giancarlo, R., 2013, The Power of Algorithms. pag. 167-186 20 pag.

Risultato della ricerca: Chapter

Molecular biology
life sciences
Computer science
Medicine
synergy
6 Citazioni (Scopus)
Microarray Data Analysis
Microarray Analysis
Microarrays
Distance Function
Clustering algorithms

Forewords-Special Issue Combinatorial Pattern Matching 2011

Giancarlo, R. & Manzini, G., 2013, In : Theoretical Computer Science. 483, pag. 1-182 182 pag.

Risultato della ricerca: Article

The Three Steps of Clustering in the Post-Genomic Era

Lo Bosco, G. & Giancarlo, R., 2013, Biological Knowledge Discovery Handbook. pag. 521-556 36 pag.

Risultato della ricerca: Chapter

2012
12 Citazioni (Scopus)
Cluster Validity
Microarray Data Analysis
Microarrays
Model Selection
Statistical method
2 Citazioni (Scopus)

Stability-Based Model Selection for High Throughput Genomic Data: An Algorithmic Paradigm

Giancarlo, R. & Utro, F., 2012, Lecture Notes in Computer Science, Vol. 7597. pag. 260-270 10 pag. (LECTURE NOTES IN COMPUTER SCIENCE).

Risultato della ricerca: Chapter

Model Selection
High Throughput
Genomics
Paradigm
Throughput
18 Citazioni (Scopus)
Computational Biology
Data compression
Data Compression
Bioinformatics
Compression
2011

Algoritmica Per Le Scienze Della Vita

Giancarlo, R., 2011, L'Informatica Invisibile. pag. 165-183 19 pag. (Minerva Saggi).

Risultato della ricerca: Chapter

42 Citazioni (Scopus)

Genome-wide characterization of chromatin binding and nucleosome spacing activity of the nucleosome remodelling ATPase ISWI

Corona, D., Lo Bosco, G., Di Gesu', V., Giancarlo, R., Lo Bosco, G., Sala, A., Pinello, L. & Toto, M., 2011, In : EMBO Journal. 30, pag. 1766-1777 11 pag.

Risultato della ricerca: Article

Nucleosomes
Chromatin
Adenosine Triphosphatases
Genes
Genome
2 Citazioni (Scopus)

Novel Combinatorial and Information Theoretic Alignment Free Distances for Biological Data Mining

Sciortino, M., Epifanio, C., Giancarlo, R. & Gabriele, A., 2011, Algorithms in Computational Molecular Biology: Techniques, Approaches and Applications. 42 pag. (WILEY SERIES IN BIOINFORMATICS).

Risultato della ricerca: Chapter

Data Mining
Alignment
Information Theory
Combinatorics
Experiment

Preface

Giancarlo, R. & Manzini, G., 2011, Combinatorial Pattern Matching, 22nd Annual Symposium. pag. 1-2 2 pag. (Lecture Notes in Computer Science).

Risultato della ricerca: Chapter

14 Citazioni (Scopus)
Microarray Data Analysis
Microarray Analysis
Microarrays
Cluster Analysis
Clustering
10 Citazioni (Scopus)

The Three Steps of Clustering in the Post-Genomic Era: A Synopsis

Lo Bosco, G., Giancarlo, R., Utro, Utro, F. & Pinello, L., 2011, Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics, 7th International Meeting, CIBB 2010, Palermo, Italy, September 2010 Revised Selected Papers. pag. 13-30 18 pag. (Lecture Notes in Bioinformatics).

Risultato della ricerca: Chapter

Cluster analysis
Genomics
Clustering
Cluster Analysis
Clustering algorithms
2010
26 Citazioni (Scopus)

Distance Functions, Clustering Algorithms and Microarray Data Analysis

Giancarlo, R., Lo Bosco, G. & Pinello, L., 2010, pag. 125-138. 14 pag.

Risultato della ricerca: Other

Microarray Data Analysis
Microarrays
Distance Function
Microarray Data
Clustering algorithms
messages
genome
proteins
deoxyribonucleic acid
sheds
2009
1 Citazione (Scopus)

Basic Statistical Indices for SeqAn

Rombo, S. E., Giancarlo, R., Rombo, S. E. & Utro, F., 2009, Biological Sequence Analysis Using the SeqAn C++ Library. pag. 271-282 12 pag.

Risultato della ricerca: Chapter

Statistical Indexes for Computational and Data Driven Class Discovery in Microarray Data

Giancarlo, R. & Utro, F., 2009, Biological Data Mining. pag. 295-336 42 pag.

Risultato della ricerca: Chapter

65 Citazioni (Scopus)

Textual Data Compression In Computational Biology: A synopsis

Giancarlo, R. & Utro, F., 2009, In : Bioinformatics. 2009, pag. 1575-1586 12 pag.

Risultato della ricerca: Article

Data Compression
Computational Biology
Data compression
Software
Information Theory
29 Citazioni (Scopus)

The Myriad Virtes of Wavelet Trees

Giancarlo, R., Ferragina, P. & Manzini, G., 2009, In : Information and Computation. 207, pag. 849-866 18 pag.

Risultato della ricerca: Article

Data compression
Data Compression
Data structures
Data Structures
Wavelets
2008

2D-Pattern Indexing

Giancarlo, R., 2008, Encyclopedia of Algorithms. pag. 1-3 3 pag.

Risultato della ricerca: Chapter

data structures

Algorithms in Bioinformatics

Giancarlo, R. & Hannenhalli, S., 2008, In : IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. 5, pag. 482-483 2 pag.

Risultato della ricerca: Article

6 Citazioni (Scopus)
Pattern Discovery
Computational Analysis
Cluster analysis
Cluster Analysis
Microarrays
36 Citazioni (Scopus)
Cluster Validation
Microarray Data Analysis
Microarray Analysis
Microarrays
Cluster Analysis
3 Citazioni (Scopus)

New Results in Finding Common Neighborhoods in Massive Graphs in the Data Streaming Model

Giancarlo, R., Racz, Buchsbaum & Giancarlo, R., 2008, In : Theoretical Computer Science. 407, pag. 302-309 8 pag.

Risultato della ricerca: Article

Streaming Data
Computer science
Models of Computation
Graph in graph theory
Data Streams
18 Citazioni (Scopus)

Periodicity and repetitions in parameterized strings

Giancarlo, R. & Apostolico, A., 2008, In : Discrete Applied Mathematics. 156, pag. 1389-1398 10 pag.

Risultato della ricerca: Article

Periodicity
Strings
Repetition

Table Compression

Giancarlo, R., 2008, Encyclopedia of Algorithms. pag. 973-975 3 pag.

Risultato della ricerca: Chapter

Data compression
2007
7 Citazioni (Scopus)

$O(n^2 logn)$ Time On-line Construction of Two-Dimensional Suffix Trees

Giancarlo, R., Na, J. C. & Park, K., 2007, In : Algorithmica. 48, pag. 173-186

Risultato della ricerca: Article

Suffix Tree
Image Compression
Square matrix
Image compression
Time Constant