Determinazione quantitativa di mRNA tramite trascrizione inversa (RT)-Real time PCR come indice di vitalità dell'inoculo di Phytophthora spp. nel suolo e nel materiale vegetale: amplificazione del RNAm dei geni COX I e COX II

Project: Research project

Project Details

Description

Questa UO svilupperà, in stretta collaborazione con l’UO IV e con ricercatori dell’Università di Berkeley (California, USA), un novo metodo di diagnosi molecolare basato sulla RT-PCR in tempo reale, con primer disegnati sulla base delle sequenze di cDNA ottenute, a loro volta, da trascritti (mRNA) dei geni mitocondriali COX I e COX II. I compiti di questa UO saranno i seguenti: ottimizzazione dei metodi di campionamento; messa a punto dei procedimenti di estrazione dell’mRNA dalle matrici (tessuti vegetali, terreno, acqua); sintesi del cDNA tramite “two steps” RT-PCR; disegno di sonde TaqMan; validazione del nuovo metodo e confronto con altri metodi di diagnosi; applicazione del nuovo metodo per lo studio dell’ecologia di Phytophthora spp. in ambienti naturali e per la diagnosi di specie da quarantena.

Layman's description

Nuovi metodi molecolari di diagnosi per lo studio dell'ecologia e dell'epidemiologia di specie terricole di Phytophthora potenzialmente pericolose per gli ecosistemi seminaturali, forestali e agrari
StatusActive
Effective start/end date1/1/06 → …